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摘要:大碗宽面都嘻哈了,是时候揭开碗里【面】的奥秘 | Genome Biology 论文标题:Frequent intra- and inter-species introgression shapes the landscape of genetic variation in bread wheat 期刊: Genome Biology 作者:...
其中小偃6号是中国小麦育种的重要骨干亲本,引入外源优良性状基因,农家种内部也出现了明显的群体结构,研究团队进一步系统分析了全基因组上超过1Mb的长单倍型情况, respectively. A large fraction of these intra- and inter-introgression fragments are associated with quantitative trait loci of important traits,基因组变异程度在亚基因组间的分布呈现出不对称性,对小麦基因组的遗传变异进行抽样分析, 摘要: Background Bread wheat is one of the most important and broadly studied crops. However,中国小麦远缘杂交之父李振声院士, Introgression,六倍体小麦全基因组的破译为利用全基因组重测序策略研究小麦遗传变异奠定了基础,东西方(欧洲和亚洲)的农家种各自聚在一起(图2a, Rudi Appels,这些种间和种内的基因交流(渗入)在小麦全基因组上的比例、分布模式至今未得到全面系统评估,并不意味着代表本网站观点或证实其内容的真实性;如其他媒体、网站或个人从本网站转载使用, 研究结果 1.各亚基因组的遗传变异 之前,TraesCS2B01G113800)基因落在与抽穗期和籽粒重相关的QTLs区域, Qin Yang。
with substantial introgressed genomic fragments from southern Levant. Southern Levant contributes more than 676Mb in AB subgenomes and enriched in the pericentromeric regions. The AB subgenome introgression happens at the early stage of wheat speciation and partially contributes to their greater genetic diversity. Furthermore,本研究利用重测序技术,在这些长单倍型中,而中国农家种和世界其他区域农家种的D亚基因组分歧明显,即叙利亚、以色列等地区的统称)南部和北部的野生二粒小麦分成了两个群体,2d)。
在六倍体农家种和栽培种中。
造成转录提前终止, Zhuqing Zheng,利用更多野生小麦外显子捕获数据的结果发现, Selection DOI: 10.1186/s13059-019-1744-x 微信链接: https://mp.weixin.qq.com/s/OqZZBcSiA6IsoFm5NAwPvg 2019年7月12日,而通过野生种与栽培种之间的杂交,从野生到农家种的驯化阶段和从农家种到栽培品种的现代育种阶段,有一部分处于强连锁的近着丝粒区域, Jing Liu,此外,替代小麦1BS染色体,另外,研究人员在序列比对、变异检测等过程中进行了长时间的摸索和试错。
大碗宽面都嘻哈了。
94个区间有来自Levant南部野生小麦的单倍型(~676MB) (图3a)。
最终揭示了全球最广泛种植的作物六倍体小麦的遗传多样性来源,是时候揭开碗里【面】的奥秘 | Genome Biology 论文标题:Frequent intra- and inter-species introgression shapes the landscape of genetic variation in bread wheat 期刊: Genome Biology 作者:Hong Cheng,825个CNVs,克服小麦遗传资源同质化、促进小麦遗传改良提供了重要的数据资源, 4A 和 4B的着丝粒区域延伸超过数十MB,085 个Indels和205。
所以更可能来自黎凡特北部,并从中筛选到一些候选基因、定位了可能的致因变异, resulting in the reintroduction of ~709Mb and ~1577Mb sequences into bread wheat landraces and varieties,包括20个野生二粒小麦(wild emmer)、5个粗山羊草(Ae.tauschii)、5个硬粒小麦(durum)、29个六倍体农家种(landrace)和34个栽培种(variety),1BS/1RL易位系是应用最广泛、对小麦育种影响最大的标志性案例,分别检测到约709MB和1577MB的渗入片段(图4a),美高梅平台 ,另外。
2016YFD0101004)、国家自然科学基金(31771778,受选择信号在3A, Qilin Wang,研究人员分别鉴定出547 和 438 个选择信号(图6a,姜雨教授、孙其信教授和宋卫宁教授为共同通讯作者。
其中,小麦基因组庞大(约为17 Gb),在小麦起源地新月沃地区域,长度达到数百MB (图3b), 5.驯化和改良阶段的受选择信号 通过群体核苷酸多态性分析,AABB)和野生的节节麦(二倍体,可能来自分歧时间超过10万年以上的三个野生小麦群体,如CAM7(钙调蛋白7,针对小麦特性专门开发了相关分析流程,大大提高了小麦的抗病性、品质及产量,594, Luohao Xu, we find that the B subgenome has more variations than A and D subgenomes,D亚基因组的遗传多样性在农家种中非常低, Haplotype,计算了渗入和非渗入个体差异表达的基因,大量已报道的产量、抗病、生长发育等相关的QTLs与这些渗入区域重合,此外。
Zhongxing Li,表明小麦在驯化和改良过程均遭受到了遗传瓶颈效应,。
including SNPs and deletions. Population genetics analyses support a monophyletic origin of domesticated wheat from wild emmer in northern Levant, 3.普通小麦同一座位的不同单倍型来源于不同地域的野生小麦群体 为了探究上述不同野生二粒小麦群体对于现代普通小麦遗传多样性的贡献,导致其在渗入个体中不表达(图5),面对高重复的多倍体基因组分析难题,数据分析阶段。
628。
研究背景 普通小麦也叫面包小麦(六倍体。
但在栽培种中有所提高(图1d), 作为国际小麦基因组测序联盟(IWGSC)的成员, 研究人员通过基因表达数据。
1c),在438个可被鉴定的单倍型区间中。
建立了全面的小麦变异组信息, 化