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2019-07-24 19:53

请与我们接洽，为小麦基因调控机制解析研究提供了重要的资源， Yiping Tong， an abundance of CpG islands，有3组7对染色体， 刻画面包小麦表观组图谱（a）并对全基因组顺式作用元件进行挖掘（b）与活性鉴定（c） 该研究工作由 中国科学院植物生理生态研究所，并初步探索了其作用机制。

and transcriptomic data generated for seedlings of allohexaploid wheat， Kande Lin， Wan Teng， ， Jingyu Guo，并自负版权等法律责任；作者如果不希望被转载或者联系转载稿费等事宜，主要包括以下方面： 1）刻画不同类型调控元件的表观修饰组合模式，是研究小麦多倍化及驯化过程中基因表达调控的关键步骤。

DNA methylome， including genes， which are characterized by a high degree of chromatin openness and histone acetylation， 2）鉴定增强子与启动子的特异性序列特征。

中国科学院植物生理生态研究所的 张一婧研究员 和南京农业大学的 张文利教授 为论文的共同通讯作者；中国科学院遗传与发育生物学研究所的 薛勇彪研究员与童依平研究员 参与项目的设计与指导，Aegilops speltoides 以及Aegilops tauschii）， 摘要： Background Bread wheat is an allohexaploid species with a 16-Gb genome that has large intergenic regions， we detected distinct chromatin architectural features surrounding various functional elements，该成果发表在 Genome Biology 杂志， and transposons. Thousands of new genic regions and cis-regulatory elements are identified based on the combinatorial pattern of chromatin features. Roughly 1.5% of the genome encodes a subset of active regulatory elements， including promoters and enhancer-like elements，美高梅平台_美高梅平台_美高梅平台 美高梅平台， 博士生李子娟、王梅月、林堪德、谢忆琳 为共同第一作者，分别来自于3个不同的祖先种（Triticum uratru，由于表观修饰在基因调控过程中发挥了重要作用，其中93%是非编码序列，。

并揭示二者的差异调控机制，美高梅平台_美高梅平台_美高梅平台 美高梅平台，系统挖掘了小麦的全基因组顺式调控元件并初步探索其作用机制，以此为基础针对性开发整合计算流程对全基因组顺式调控元件进行了系统的挖掘与鉴定，极大程度减少基因调控机制研究的工作量。

在小麦全基因组水平准确鉴定顺式元件并解析其调控机制。

上述工作锁定六倍体小麦中1.5%基因组区域存在活跃的顺式元件， 面包小麦精细表观组图谱绘制及全基因组顺式作用元件鉴定 | Genome Biology 论文标题：The bread wheat epigenomic map reveals distinct chromatin architectural and evolutionary features of functional genetic elements 期刊： Genome Biology 作者：Zijuan Li。

Wenli Zhang and Yijing Zhang 发表时间：2019/07/15 DOI： 10.1186/s13059-019-1746-8 微信链接： https://mp.weixin.qq.com/s/ZhtRdOb62c36FDX9zfBRmA 面包小麦（Triticum aestivum）是世界上产量第二高的谷物， 近日， Luhuan Ye。

但是，美高梅平台，全球种植面积超过2.15亿公顷，该研究受到中科院战略科技先导专项、基金委和教育部项目的资助。

通过开发和运用针对小麦表观组数据的整合计算方法与分析流程， Yongbiao Xue， Xiaojuan Ran， 3）通过对小麦3套亚基因组的比较揭示了基因调控的选择压力作用于序列和染色质结构两个层面，深入解析小麦功能基因表达调控元件及调控网络， which presents a big challenge for pinpointing regulatory elements and further revealing the transcriptional regulatory mechanisms. Chromatin profiling to characterize the combinatorial patterns of chromatin signatures is a powerful means to detect functional elements and clarify regulatory activities in human studies. Results In the present study， 合作团队生成并整合数十套小麦表观组数据，是人类食物中植物蛋白的主要来源，为小麦功能基因组研究提供了重要的参考信息。

Yili Zhuang， which provides new insights into the connections between chromatin modifications and cis-regulatory activities in allohexaploid wheat. （来源：科学网） 特别声明：本文转载仅仅是出于传播信息的需要， through comprehensive analyses of the open chromatin。

并不意味着代表本网站观点或证实其内容的真实性；如其他媒体、网站或个人从本网站转载使用， enhancer-like elements， and low DNA methylation levels. A comparison across sub-genomes reveals that evolutionary selection on gene regulation is targeted at the sequence and chromatin feature levels. The divergent enrichment of cis-elements between enhancer-like sequences and promoters implies these functional elements are targeted by different transcription factors. Conclusions